正式名称は日本国。
現在の通称は、日本。その昔は日本を指す言葉として神州、本朝などがあった。
また、明治時代から終戦までの国号は大日本帝國であり、当時は帝國、皇國ともいわれた (國は国の旧字体) 。また、現在でも日本国の印鑑「国璽」には「大日本」の名称が使用されている。

国名の読み方には「にっぽん」と「にほん」の2通りの読み方がある。日本政府は正式な読み方を明確に定めていない。

公式の英語表記は、Japan（ジャパン）。略記としてはJPNが用いられる。
JAPは、特に英語では侮蔑的な意味を持つので、その傾向が薄い他言語においても使用を控えるべきである。
また、最近の英語表記には、Nippon が用いられることが多い。
UPU等によるローマ字表記 (1965年以降)、日本郵政公社の切手や日本銀行券などでNippon表記を用いる。
Nipponの先頭三文字NipはJAPよりも強い侮蔑、差別の意味合いがあるので略記は使用するべきではない。